Cette thèse, proposée conjointement par l’ASTREDHOR et l’équipe GDO de l’UMR IRHS (INRAE – Institut Agro – Université d’Angers), vise à étudier les déterminants génétiques et biochimiques de la résistance du rosier aux thrips, un ravageur majeur des cultures horticoles.

Le projet associe des approches de phénotypage, de génétique d’association (GWAS) et de métabolomique, dans l’objectif d’identifier de nouveaux leviers pour la sélection de variétés résistantes.

Le.la candidat.e devra avoir de bonnes connaissances en génétique végétale (génétique quantitative) et en biochimie. Des connaissances sur les interactions plantes-ravageurs seraient un atout. 
Le projet demandera un important travail de phénotypage chez les différents partenaires. Une grande rigueur sera nécessaire afin de gérer les divers jeux de données (phénotypiques, génotypiques, métabolomiques et volatilomiques).

Résumé de la thèse

Afin d’évaluer la présence de résistances naturelles des plantes, il est envisagé dans cette thèse d’étudier la capacité intrinsèque de variétés de rosier à résister ou à être faiblement infestées par le thrips. Les interactions entre le rosier et le thrips restent peu documentées. Toutefois, certains caractères de la plante, tels que la couleur et la morphologie des fleurs, l’architecture de la plante ainsi que les composés organiques volatils, sont connus pour influencer l’attraction ou la répulsion du thrips.
Quelques études ont montré une variabilité de réponse des rosiers vis-à-vis du thrips. Cette thèse propose alors de caractériser cette interaction rosier-thrips (résistance/sensibilité ou répulsion/attractivité). Pour se faire, le.la doctorant.e suivra la méthodologie suivante : (i) caractérisation phénotypique d’une collection de rosiers pour l’étude de l’attractivité/répulsion du thrips ; (ii) étude du déterminisme génétique de l’interaction (approche GWAS), et (iii) analyse du volatilome et du métabolome du bouton floral au cours de l’interaction.

Mots-clés : rosier, thrips, interaction plante-ravageur, génétique, métabolomique, COV

Infos pratiques

La thèse se déroulera principalement à Angers, en collaboration avec plusieurs partenaires académiques et professionnels.

Date limite de candidature : 13 novembre 2026
Début de la thèse : 1er avril 2027

Documents à fournir :
  - CV
  - lettre de motivation
  - deux avis de référents scientifiques
 

Le dossier complet est à envoyer à Fabrice Foucher, directeur de thèse, ainsi qu’à Vanessa Soufflet-Freslon et Laurent Ronco, encadrants de la thèse.

En savoir plus :