BioInformatics for plant DEFense Investigations

BioInformatics for plant DEFense Investigations

BIDEFI

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L’équipe BIDEFI (BioInformatics for plant DEFense Investigation) est une équipe de  recherche pluridisciplinaire qui regroupe des compétences en développement informatique (pipelines, interfaces, bases de données), en génomique structurale et fonctionnelle, en évolution des génomes, en méta-analyse du transcriptome et en statistiques. Ses activités de recherche s’organisent autour de deux grands axes : 

  • L'identification et la caractérisation fonctionnelle de petits peptides sécrétés impliqués dans le contrôle du développement de la plante et/ou dans les mécanismes de défense avec l'objectif de découvrir de nouveaux outils de biocontrôle.
  • La compréhension de l'impact des stress environnementaux sur la dynamique évolutive des familles de gènes et de l’évolution des génomes des rosacées via le développement de méthodologie en apprentissage statistique pour améliorer les prédictions génomiques.
     

L’équipe BIDEFI est également impliquée (i) dans des activités d’enseignement de bioinformatique et statistiques dans les filières de Biologie Végétale, de Biologie et Santé, d'Ecologie et de Data Science de l’Université d’Angers ; (ii) dans les programmes de sensibilisation et de communication DigiFilles et Declics.