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Comme tout être vivant, les graines sont dotées d’un microbiote, jusqu’à présent peu étudié. Les graines sont vectrices de nombreux micro-organismes dont certains responsables de maladies pour la plantes issue de la graine. Une des méthodes de lutte biologique contre ces maladies repose sur la compétition entre micro-organismes pour les ressources nutritives comme les sucres ou les acides aminés.

Au cours de ce travail, le partage des ressources nutritives entre la bactérie pathogène Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), agent responsable de la nervation noire des crucifères, et certaines souches bactériennes associées aux graines de radis a été estimé. De manière générale, ces prédictions indiquent un degré de partage des ressources nutritives inférieur à 50 % entre Xcc et les souches bactériennes analysées, ce qui limiterait les phénomènes de compétition entre ces bactéries. Toutefois quelques souches de Stenotrophomonas rhizophila, appartenant à la même famille taxonomique que Xcc, possèdent un degré de partage plus important. Des tests de confrontations pour les ressources entre Xcc et S. rhizophila, réalisés sur des exsudats de graine de radis, ont démontré une diminution de la taille de population de Xcc lors de l’interaction avec ces souches.

La bactérie S. rhizophila est un candidat prometteur pour diminuer la charge bactérienne de Xcc et ainsi limiter sa fréquence de transmission aux graines de radis. Des expériences complémentaires doivent maintenant être réalisées pour comprendre comment S. rhizophila se transmet aux graines de radis.

Partenaires : cette étude a été menée par l’unité IRHS (Angers) en collaboration avec le laboratoire national Oak Ridge (Oak Ridge, Tennessee, USA), l’institut technologique autrichien (AIT, Vienne, Autriche) et la plateforme génomique GeT-PlaGe (Toulouse).

Publications associées : Torres-Cortes et al., 2019, Differences in resource use lead to coexistence of seed-transmitted microbial populations, Scientific Reports, 9(6648). DOI:10.1038/s41598-019-42865-9.