L'arbre généalogique des pommiers anciens reconstitué

Les variétés de pommier peuvent être maintenues pendant des siècles dans des vergers ou des conservatoires grâce au greffage. Certaines d'entre elles sont supposées dater du Moyen-Age ou même de l'Antiquité romaine. Grâce aux collections de ressources génétiques conservées à l’unité IRHS (Angers) et dans différents conservatoires européens, des chercheurs INRAE ont pu reconstituer les relations d’apparentement entre ces variétés anciennes et apporter des informations nouvelles sur l’histoire de la sélection de cette espèce au cours des siècles passés.

Des relations de parentés impliquant plus de 800 variétés ont été identifiées à l'aide de données de marquage moléculaire dense (empreintes génétiques) obtenues sur plus de 1400 variétés anciennes ou locales de pommier. Les parents de variétés emblématiques telles que ‘Calville Blanc d’Hiver’ (France), ‘Transparente de Croncels’ (France), 'Ribston Pippin' (Grande-Bretagne) ou encore 'White Transparent' (Pays Baltes) ont été déterminés. L'arbre généalogique reconstitué couvre sept générations. Il met en lumière la contribution très importante et inattendue de deux variétés normande et anglaise datant de la Renaissance, 'Reinette Franche' et 'Margil', ainsi que celle de la variété russe 'Alexander' datant du XVIII^ème siècle.

Ces résultats coïncident avec les écrits de l’éminent pomologiste angevin André Leroy qui indiquait déjà en 1873 que la Reinette Franche était « la doyenne d’un groupe considérable de pommiers et lui [avait légué] son nom » (c.à.d. la plupart des ‘Reinettes’). Les variétés plus anciennes, du Moyen-Age ou de l'Antiquité, ne présentent pour l’instant que peu ou pas de descendants directs dans l'échantillon étudié. Mais l’ensemble des résultats obtenus illustre remarquablement l'histoire de la sélection empirique ancienne et plus récente du pommier.

Une analyse plus large, impliquant des variétés conservées dans d'autres collections, est en cours. Elle permettra probablement d'identifier d'autres relations de parentés et d'étendre ainsi l'arbre généalogique reconstruit. L'arbre généalogique obtenu ouvre d’ores et déjà des pistes pour accélérer la création de nouvelles variétés à l'aide des marqueurs moléculaires.

Partenaires : ces résultats ont été obtenus dans le cadre d'une collaboration entre les équipes ResPom et VaDiPom de l'UMR IRHS (à Angers) et des partenaires du projet européen FruitBreedomics : University of Bologna (IT), University of Reading (UK), Fondazione Edmund Mach (IT), Centre Wallon de Recherches Agronomiques (BE), University of Agricultural Sciences (SW), Research and Breeding Institute of Pomology Holovousy (CZ), avec l'apport de pomologistes de l'association "Les Croqueurs de Pommes du Confluent Ain-Isère-Savoie".

Financement : cette étude a été financée par le projet européen FruitBreedomics, No. 265582: Integrated Approach for increasing breeding efficiency in fruit tree crops

Référence de la piblication : Muranty H., Denancé C., Feugey L., Crépin J.L., Barbier Y., Tartarini S., Ordidge M., Troggio M., Lateur M., Nybom H., Paprstein F., Laurens F., Durel C.E. (2019). Using whole-genome SNP data to reconstruct a large multi-generation pedigree in apple germplasm. BMC Plant Biology, doi: 10.1186/s12870-019-2171-6.

Contacts :

• Charles-Eric Durel : charles-eric.durel@inrae.fr
• Hélène Muranty : helene.muranty@inrae.fr