ROSADUPLI

Depuis les travaux de Ohno en 1970, il est communément admis que la duplication de gènes est un facteur important de l’évolution des espèces, en particulier chez les angiospermes. Cette hypothèse s’est vue confortée dans les années 2000 avec les projets de séquençage de génomes complets qui ont montré que la duplication de génomes est un moteur d'innovation génétique chez les organismes eucaryotes que ce soit chez les plantes mais aussi les animaux. Cependant la façon dont les gènes dupliqués évoluent et se fixent dans un génome reste une question centrale en évolution moléculaire.
Nous faisons l’hypothèse que le devenir des gènes dupliqués varie selon la nature de la duplication (duplication ancestrale complète de génome - WGD, duplication en tandem ou duplication dispersée). Nous proposons d’explorer cette hypothèse de manière systématique chez les Rosacées par une approche sans a priori. 
Nous avons développé une base de données ROSADUPLI qui contient toutes les familles de gènes des génomes du pommier, du poirier, du pêcher, du fraisier sauvage, du fraisier domestiqué et de l’arabette (en tant que groupe externe) ainsi que la nature des duplications qui a permis l’expansion des familles.

Financements : Univ. Angers, INRAE

PhD : T. LALLEMAND, M. LEDUC, A. BOUANICH 

Collaborations : N. LEDUC (STREMHO, IRHS Angers), J. CLOTAULT (GDO, IRHS Angers), C. RIZZON (LaMME, Univ. Evry)

PI : C. LANDES