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Le déterminisme génétique de la résistance partielle et quantitative d’un génotype de R. wichurana a été étudié à partir de trois populations interconnectées, et a permis de mettre en évidence deux QTL majeurs et stables sur les chromosomes 3 et 5. L’interaction entre R. wichurana et D. rosae a également été étudiée au niveau histologique et transcriptomique. Ces travaux ont été réalisés au cours de la thèse de Diana Carolina Lopez Arias, soutenue en juin 2021  

Par ailleurs, une collection de souches monosporées de D. rosae a été établie. Les séquences  des génomes de deux souches, l’une sur rosier moderne, l’autre isolée sur rosier sauvage ont été utilisées pour développer des marqueurs microsatellites. Une étude de la diversité génétique de cette collection a été menée et a montré une structuration liée à l’hôte (moderne vs sauvage). Un test de caractérisation de la sensibilité/résistance en serre et sur plantules entières est disponible pour caractériser les nouvelles variétés (projet Belarosa – Marolleau et al, 2020, Figure 1). 

Cette thématique se poursuit actuellement avec le développement i) d’un projet Starter (INRAe-BAP 2021-2022) GeRARD (Towards Genes for RosA Resistance to black spot Disease) dont les objectifs sont d’identifier les gènes candidats  et les fonctions associés aux deux principaux QTL de résistance à la tache noire de R. hyb. wichurana et ii) d’un projet Ecophyto (RoBIO – 2022-2024) dont les objectifs sont de développer des outils de caractérisation de la réponse des rosiers à différentes maladies fongiques, et de mettre en place une stratégie d’identification de produits de biocontrôle dans un premier temps en laboratoire, puis en serre et au final en plein champ.

Figure 1: Résistance à la maladies des taches noires chez le rosier. a) Développement d’un test en conditions contrôlées avec souches monosporées b) Caractérisation de la diversité d’une collection de souches monosporées de Diplocarpon rosae collectées dans les compartiments des rosiers modernes et sauvages (Marolleau et al, 2020). c) Détection de QTLs de résistance à la maladie des taches noires (groupe de liaison 3 après méta-analyse : Lopez-Ariaz et al, 2020)