Pierre BOUILLON

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Le projet de thèse CIFRE porte sur la caractérisation du déterminisme génétique et épigénétique du développement de la chair rouge et du brunissement en conservation chez la pomme.

La première partie de la thèse a pour objectif la caractérisation phénotypique de populations de pommiers à chair rouge. Ce phénotypage permettra de mesurer l’intensité et de caractériser la répartition de la couleur dans la chair des fruits. Une étude cinétique du brunissement de la chair en conservation sera également conduite. Des méthodes basées sur l’imagerie numérique seront testées. De plus des méthodes de phénotypage non destructives d’analyse de la couleur rouge et du brunissement chez le fruit seront développées. Enfin, la composition en métabolites secondaires de la chair des fruits sera investiguée.

Dans un second temps, le déterminisme génétique de la couleur de la chair sera étudié. Le génotypage de l’ensemble des individus et l’analyse des résultats aboutira à l’identification de QTLs contrôlant le développement de la chair rouge et l’apparition du brunissement après récolte. Des analyses seront ensuite conduites afin permettre la mise en évidence d’éventuels facteurs épigénétique en lien avec l’expression desdits caractères.

A terme, l’ensemble de ces données permettra la construction de modèles moléculaires associés au développement de la chair rouge et au brunissement chez la pomme. Ces travaux conduiront au développement de marqueurs moléculaires utilisables en sélection dans le cadre de la SAM.

• Compétences

épigénétique, pomme